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解决方案

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宝德高性能计算之生命科学解决方案
项目背景

多场景应用多需求:生物信息学(序列搜寻比对分析)--需要较大的内存容量和内存带宽, 需要直连架构CPU;分子动力学--对网络需求比较大,节点间需要使用低延时,高带宽的Infiniband高速网;分子对接(药物设计)--计算量非常大,消耗计算机时很多;测序仪离线处理--内存、存储容量需求大,作业运行需要与作业调度系统结合;电子显微镜图象处理--软件内存需求和IO需求较大,计算时间长,系统稳定性、可靠性要求高;质谱仪原始资料处理--系统计算量大,计算时间长,系统稳定性,可靠性要求高。

方案介绍

基于宝德PowerScale 8000高性能计算集群是一个有机的、高性能、高可靠性的集群系统。系统的硬件都选用经过严格测试的主流产品,保证系统的可靠性;互联系统各组件的网络都是专用的高效网,通过集群核心的管理系统使得整个系统协调一致的运行,如单独的一台高性能计算机一样为用户提供统一的服务。PowerScale 8000向用户提供一个单一计算机的界面。前置计算机负责与用户交互,并在接受用户提交的计算任务后通过调度器程序将任务分配给各个计算节点执行;运行结束后通过前置计算机将结果返回给用户。程序运行过程中的进程间通信通过专用网络进行。

方案解析

PowerScale 8000系统共配置10 个双路八核刀片服务器。刀片式集群系统在计算密度、功耗散热、运营成本、维护成本、可靠性等方面,都明显优于其它系统,且为系统的扩容升级提供了良好的基础。计算系统的选择实现了多样化,分别配置了最通用的双路八核的刀片节点,这样的配置可以更好满足不同应用的需求。配置高性能的光纤 SAN 存储系统,配置 20TB 磁盘阵列存储,配置并行文件系统,实现了多分区的统一管理和多通道的并发读写。管理网络采用千兆网络,计算网络采用Infiniband高速网络互连;主要产品都采用了冗余设计(电源、风扇等),存储系统采用双链路冗余设计,系统的可靠性有较高保证;对于与测序仪链接的服务器和存储设备,配置了双机热备,保证了系统的可靠性。宝德公司将为用户提供完善的服务,包括安装调试、系统优化、用户培训等,这些都不单独收费,用户不必考虑这些方面的费用。

方案优势
  • 系统

    系统协调高效

  • 高性价比

    高性价比且方便后期扩容升级

  • 高可靠性

    高可靠性和完善的服务

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